Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAN2Q504Q3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAN2Q504Q3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAN2Q504Q3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PAN2Q504Q3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PAN2Q504Q3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAN2Q504Q3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms