Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GREB1Q4ZG55 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GREB1Q4ZG55 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GREB1Q4ZG55 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.9 ms