Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPC1LQ4VXU2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC1LQ4VXU2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC1LQ4VXU2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PABPC1LQ4VXU2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC1LQ4VXU2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PABPC1LQ4VXU2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PABPC1LQ4VXU2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PABPC1LQ4VXU2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PABPC1LQ4VXU2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms