Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MINDY4Q4G0A6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MINDY4Q4G0A6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MINDY4Q4G0A6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MINDY4Q4G0A6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms