Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC153Q494R4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC153Q494R4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC153Q494R4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC153Q494R4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms