Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HLA-BQ31612 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-BQ31612 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-BQ31612 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HLA-BQ31612 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms