Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC96Q2M329 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC96Q2M329 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC96Q2M329 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC96Q2M329 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms