Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ISXQ2M1V0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ISXQ2M1V0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ISXQ2M1V0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ISXQ2M1V0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms