Protein–RNA interactions for Protein: Q17RN3

FAM98C, Protein FAM98C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM98CQ17RN3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FAM98CQ17RN3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FAM98CQ17RN3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
FAM98CQ17RN3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
FAM98CQ17RN3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FAM98CQ17RN3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FAM98CQ17RN3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FAM98CQ17RN3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FAM98CQ17RN3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FAM98CQ17RN3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FAM98CQ17RN3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
FAM98CQ17RN3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FAM98CQ17RN3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FAM98CQ17RN3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FAM98CQ17RN3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
FAM98CQ17RN3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FAM98CQ17RN3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FAM98CQ17RN3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FAM98CQ17RN3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FAM98CQ17RN3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FAM98CQ17RN3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FAM98CQ17RN3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FAM98CQ17RN3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FAM98CQ17RN3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FAM98CQ17RN3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FAM98CQ17RN3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FAM98CQ17RN3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
FAM98CQ17RN3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FAM98CQ17RN3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FAM98CQ17RN3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FAM98CQ17RN3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
FAM98CQ17RN3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
FAM98CQ17RN3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FAM98CQ17RN3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FAM98CQ17RN3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
FAM98CQ17RN3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FAM98CQ17RN3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FAM98CQ17RN3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FAM98CQ17RN3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FAM98CQ17RN3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FAM98CQ17RN3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FAM98CQ17RN3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FAM98CQ17RN3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FAM98CQ17RN3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FAM98CQ17RN3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FAM98CQ17RN3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FAM98CQ17RN3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FAM98CQ17RN3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FAM98CQ17RN3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FAM98CQ17RN3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FAM98CQ17RN3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FAM98CQ17RN3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FAM98CQ17RN3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 556.7 ms