Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRNQ16849 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRNQ16849 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRNQ16849 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRNQ16849 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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