Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIST2H2ACQ16777 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIST2H2ACQ16777 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIST2H2ACQ16777 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIST2H2ACQ16777 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIST2H2ACQ16777 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIST2H2ACQ16777 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.6 ms