Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms