Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTGISQ16647 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTGISQ16647 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTGISQ16647 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTGISQ16647 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTGISQ16647 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms