Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX2Q16385 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSX2Q16385 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX2Q16385 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSX2Q16385 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX2Q16385 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX2Q16385 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX2Q16385 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX2Q16385 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSX2Q16385 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSX2Q16385 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX2Q16385 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX2Q16385 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX2Q16385 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX2Q16385 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSX2Q16385 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX2Q16385 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSX2Q16385 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX2Q16385 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX2Q16385 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX2Q16385 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX2Q16385 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX2Q16385 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSX2Q16385 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX2Q16385 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX2Q16385 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX2Q16385 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX2Q16385 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX2Q16385 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX2Q16385 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX2Q16385 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX2Q16385 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSX2Q16385 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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