Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDSNQ15517 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDSNQ15517 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDSNQ15517 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDSNQ15517 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDSNQ15517 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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