Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC3Q15034 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC3Q15034 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC3Q15034 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC3Q15034 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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