Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD6Q15008 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD6Q15008 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD6Q15008 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD6Q15008 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMD6Q15008 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMD6Q15008 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMD6Q15008 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD6Q15008 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD6Q15008 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD6Q15008 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSMD6Q15008 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
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