Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
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