Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLCA4Q14CN2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCA4Q14CN2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCA4Q14CN2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms