Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NFIXQ14938 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NFIXQ14938 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NFIXQ14938 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NFIXQ14938 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NFIXQ14938 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NFIXQ14938 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NFIXQ14938 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NFIXQ14938 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NFIXQ14938 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NFIXQ14938 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NFIXQ14938 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NFIXQ14938 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
NFIXQ14938 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NFIXQ14938 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NFIXQ14938 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NFIXQ14938 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NFIXQ14938 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NFIXQ14938 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NFIXQ14938 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NFIXQ14938 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NFIXQ14938 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NFIXQ14938 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NFIXQ14938 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
NFIXQ14938 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NFIXQ14938 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NFIXQ14938 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NFIXQ14938 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NFIXQ14938 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NFIXQ14938 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NFIXQ14938 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NFIXQ14938 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NFIXQ14938 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
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