Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RFTN1Q14699 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFTN1Q14699 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFTN1Q14699 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFTN1Q14699 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFTN1Q14699 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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