Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3AQ14563 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3AQ14563 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3AQ14563 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3AQ14563 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3AQ14563 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
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