Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBI3Q14213 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBI3Q14213 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBI3Q14213 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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