Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SF3B2Q13435 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SF3B2Q13435 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SF3B2Q13435 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SF3B2Q13435 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SF3B2Q13435 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SF3B2Q13435 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SF3B2Q13435 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SF3B2Q13435 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SF3B2Q13435 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SF3B2Q13435 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SF3B2Q13435 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SF3B2Q13435 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SF3B2Q13435 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SF3B2Q13435 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SF3B2Q13435 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SF3B2Q13435 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SF3B2Q13435 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SF3B2Q13435 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SF3B2Q13435 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SF3B2Q13435 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SF3B2Q13435 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SF3B2Q13435 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SF3B2Q13435 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SF3B2Q13435 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SF3B2Q13435 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
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