Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSLNQ13421 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSLNQ13421 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSLNQ13421 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSLNQ13421 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MSLNQ13421 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSLNQ13421 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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