Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLN3Q13286 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLN3Q13286 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLN3Q13286 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLN3Q13286 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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