Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM32Q13049 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM32Q13049 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM32Q13049 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM32Q13049 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM32Q13049 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM32Q13049 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM32Q13049 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM32Q13049 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM32Q13049 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM32Q13049 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM32Q13049 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRIM32Q13049 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM32Q13049 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM32Q13049 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
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