Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN31Q12999 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSPAN31Q12999 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN31Q12999 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN31Q12999 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 678.2 ms