Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSTF3Q12996 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSTF3Q12996 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSTF3Q12996 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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