Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCAPQ12770 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPQ12770 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPQ12770 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAPQ12770 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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