Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 NDE1YMR145C 1683 nt7.69□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 AAT1YKL106W 1356 nt7.69□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 RAS2YNL098C 969 nt7.67□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 MAM3YOL060C 2121 nt7.67□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 CCT5YJR064W 1689 nt7.67□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 ITR1YDR497C 1755 nt7.66□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 PMA2YPL036W 2844 nt7.65□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 YMR265CYMR265C 1386 nt7.65□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 BEM1YBR200W 1656 nt7.65□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 CHA1YCL064C 1083 nt7.64□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 YDR455CYDR455C 309 nt7.64□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 SNU66YOR308C 1764 nt7.64□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 GGC1YDL198C 903 nt7.63□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 GPM1YKL152C 744 nt7.63□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 ATP10YLR393W 840 nt7.63□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 YMC2YBR104W 990 nt7.63□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 PRC1YMR297W 1599 nt7.63□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 TOP3YLR234W 1971 nt7.62□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 SAC7YDR389W 1965 nt7.61□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 RPN14YGL004C 1254 nt7.61□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 YJL118WYJL118W 660 nt7.61□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 RPT5YOR117W 1305 nt7.6□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 GAL3YDR009W 1563 nt7.6□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 YLR072WYLR072W 2082 nt7.6□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 NUC1YJL208C 990 nt7.6□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 NAP1YKR048C 1254 nt7.6□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 SEN2YLR105C 1134 nt7.6□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 HAP5YOR358W 729 nt7.6□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 PGC1YPL206C 966 nt7.6□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 CTF3YLR381W 2202 nt7.6□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 PMT7YDR307W 1989 nt7.6□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 ERG13YML126C 1476 nt7.6□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 PAU5YFL020C 369 nt7.59□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 SPE4YLR146C 903 nt7.59□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 STP3YLR375W 1032 nt7.59□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 RIB7YBR153W 735 nt7.59□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 YBR232CYBR232C 360 nt7.59□□□□□ -1.19
RTR2Q12378 SAM3YPL274W 1764 nt7.58□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 ELO1YJL196C 933 nt7.57□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 ERG6YML008C 1152 nt7.57□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 LEA1YPL213W 717 nt7.57□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 TAF13YML098W 504 nt7.56□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 YPL264CYPL264C 1062 nt7.56□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 PUP1YOR157C 786 nt7.55□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 CCR4YAL021C 2514 nt7.54□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 SUV3YPL029W 2214 nt7.54□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 MCM5YLR274W 2328 nt7.53□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.53□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.53□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.53□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 ERR3YMR323W 1314 nt7.52□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 ERR1YOR393W 1314 nt7.52□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 ERR2YPL281C 1314 nt7.52□□□□□ -1.2
RTR2Q12378 EAF3YPR023C 1206 nt7.52□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 YMR253CYMR253C 1245 nt7.51□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.5□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 OYE2YHR179W 1203 nt7.5□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 SNZ1YMR096W 894 nt7.5□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 YNR064CYNR064C 873 nt7.5□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 YJL064WYJL064W 396 nt7.49□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 MRS4YKR052C 915 nt7.49□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 MHF1YOL086W-A 273 nt7.49□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 KEL3YPL263C 1956 nt7.49□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 YIL108WYIL108W 2091 nt7.48□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 YPR126CYPR126C 309 nt7.48□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 TPS1YBR126C 1488 nt7.48□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 THI3YDL080C 1830 nt7.48□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 HXT9YJL219W 1704 nt7.47□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 GGA2YHR108W 1758 nt7.46□□□□□ -1.21
RTR2Q12378 POT1YIL160C 1254 nt7.46□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 GSF2YML048W 1212 nt7.46□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 YER152CYER152C 1332 nt7.46□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 ABP1YCR088W 1779 nt7.46□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 DDI1YER143W 1287 nt7.45□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 PAU19YMR325W 375 nt7.45□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 CRC1YOR100C 984 nt7.45□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 AFG2YLR397C 2343 nt7.44□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 PAR32YDL173W 888 nt7.44□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 snR86snR86 1004 nt7.44□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 IML3YBR107C 738 nt7.44□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 snR31snR31 225 nt7.44□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 AQR1YNL065W 1761 nt7.43□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 CTI6YPL181W 1521 nt7.43□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 ATO2YNR002C 849 nt7.43□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 RRT8YOL048C 1029 nt7.43□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 RRT6YGL146C 936 nt7.42□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 SAM50YNL026W 1455 nt7.42□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 HIS3YOR202W 663 nt7.41□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 TUB4YLR212C 1422 nt7.41□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 NDE2YDL085W 1638 nt7.41□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 WSC4YHL028W 1818 nt7.41□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 TMA23YMR269W 636 nt7.4□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.4□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 YNL040WYNL040W 1371 nt7.4□□□□□ -1.22
RTR2Q12378 POB3YML069W 1659 nt7.4□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 MAS2YHR024C 1449 nt7.38□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 KGD2YDR148C 1392 nt7.38□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 YJR114WYJR114W 393 nt7.38□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 GNP1YDR508C 1992 nt7.38□□□□□ -1.23
RTR2Q12378 MSB3YNL293W 1902 nt7.38□□□□□ -1.23
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