Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 YPR126CYPR126C 309 nt11.33□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 CTI6YPL181W 1521 nt11.32□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 KRE28YDR532C 1158 nt11.32□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 GET2YER083C 858 nt11.32□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 MOB1YIL106W 945 nt11.32□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 YBL086CYBL086C 1401 nt11.32□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.32□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.32□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 COG1YGL223C 1254 nt11.31□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 VPS20YMR077C 666 nt11.31□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 HAT1YPL001W 1125 nt11.31□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 DBP1YPL119C 1854 nt11.31□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 BUD20YLR074C 501 nt11.3□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 PHO23YNL097C 993 nt11.29□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 BNI5YNL166C 1347 nt11.29□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 HXT1YHR094C 1713 nt11.29□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 RRS1YOR294W 612 nt11.28□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 IML3YBR107C 738 nt11.28□□□□□ -0.6
MSB4Q12317 BUD16YEL029C 939 nt11.27□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 IGD1YFR017C 588 nt11.27□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 NIF3YGL221C 867 nt11.27□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 SCEIQ0160 708 nt11.27□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 KRE1YNL322C 942 nt11.27□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 DCI1YOR180C 816 nt11.27□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 TAF4YMR005W 1167 nt11.26□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 YMR147WYMR147W 672 nt11.26□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 TPS1YBR126C 1488 nt11.25□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 HAT2YEL056W 1206 nt11.24□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 GND2YGR256W 1479 nt11.24□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 DAK2YFL053W 1776 nt11.23□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 IZH4YOL101C 939 nt11.23□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 VHS2YIL135C 1311 nt11.23□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 MSC1YML128C 1542 nt11.23□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 YLR169WYLR169W 354 nt11.22□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 RRP15YPR143W 753 nt11.22□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 YCR025CYCR025C 411 nt11.21□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 MAF1YDR005C 1188 nt11.21□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.21□□□□□ -0.61
MSB4Q12317 YAT1YAR035W 2064 nt11.2□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 OYE2YHR179W 1203 nt11.2□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 SDS22YKL193C 1017 nt11.2□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 REC114YMR133W 1287 nt11.2□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 RCE1YMR274C 948 nt11.2□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 YNL024CYNL024C 741 nt11.2□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 YTH1YPR107C 627 nt11.2□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 YAP7YOL028C 738 nt11.19□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 CTR1YPR124W 1221 nt11.19□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 RAS2YNL098C 969 nt11.18□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 ACO2YJL200C 2370 nt11.17□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 RPF2YKR081C 1035 nt11.17□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 RPN8YOR261C 1017 nt11.17□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 IPL1YPL209C 1104 nt11.17□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 SAM2YDR502C 1155 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 ARC35YNR035C 1029 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 SCO2YBR024W 906 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 COA2YPL189C-A 207 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 YPR027CYPR027C 834 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 SEC61YLR378C 1443 nt11.16□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 OCA4YCR095C 1089 nt11.15□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 BTT1YDR252W 450 nt11.15□□□□□ -0.62
MSB4Q12317 YLH47YPR125W 1365 nt11.15□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 CMP2YML057W 1815 nt11.14□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 YJR154WYJR154W 1041 nt11.14□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 DLD2YDL178W 1593 nt11.13□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 SWM1YDR260C 513 nt11.12□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 OXA1YER154W 1209 nt11.12□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 SET6YPL165C 1122 nt11.12□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 EAF3YPR023C 1206 nt11.12□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt11.11□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 TVP38YKR088C 1014 nt11.11□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 NCE102YPR149W 522 nt11.11□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 YKR015CYKR015C 1707 nt11.1□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 YAP6YDR259C 1152 nt11.1□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 END3YNL084C 1050 nt11.1□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 HSL7YBR133C 2484 nt11.1□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 PAB1YER165W 1734 nt11.09□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 SHE9YDR393W 1371 nt11.09□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 FUB1YCR076C 753 nt11.09□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 RPN9YDR427W 1182 nt11.09□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 YER188WYER188W 720 nt11.09□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 MER1YNL210W 813 nt11.09□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 RTC4YNL254C 1206 nt11.09□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 UFO1YML088W 2007 nt11.09□□□□□ -0.63
MSB4Q12317 LYS20YDL182W 1287 nt11.08□□□□□ -0.64
MSB4Q12317 YEA4YEL004W 1029 nt11.08□□□□□ -0.64
MSB4Q12317 YMR114CYMR114C 1107 nt11.08□□□□□ -0.64
MSB4Q12317 SHY1YGR112W 1170 nt11.07□□□□□ -0.64
MSB4Q12317 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt11.07□□□□□ -0.64
MSB4Q12317 RXT2YBR095C 1293 nt11.07□□□□□ -0.64
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