Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNT1Q10472 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GALNT1Q10472 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GALNT1Q10472 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GALNT1Q10472 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GALNT1Q10472 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GALNT1Q10472 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GALNT1Q10472 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GALNT1Q10472 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GALNT1Q10472 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms