Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUDPQ08623 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUDPQ08623 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUDPQ08623 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUDPQ08623 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUDPQ08623 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms