Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRSF11Q05519 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF11Q05519 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRSF11Q05519 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRSF11Q05519 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms