Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTK2Q05397 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTK2Q05397 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTK2Q05397 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTK2Q05397 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTK2Q05397 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms