Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBE3AQ05086 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE3AQ05086 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3AQ05086 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3AQ05086 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3AQ05086 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3AQ05086 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3AQ05086 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms