Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAP1Q03518 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAP1Q03518 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TAP1Q03518 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAP1Q03518 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TAP1Q03518 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms