Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNB1Q02641 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNB1Q02641 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNB1Q02641 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNB1Q02641 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNB1Q02641 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNB1Q02641 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNB1Q02641 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNB1Q02641 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CACNB1Q02641 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNB1Q02641 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNB1Q02641 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB1Q02641 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNB1Q02641 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNB1Q02641 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNB1Q02641 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNB1Q02641 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNB1Q02641 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNB1Q02641 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNB1Q02641 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CACNB1Q02641 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB1Q02641 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms