Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SP4Q02446 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SP4Q02446 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SP4Q02446 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SP4Q02446 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SP4Q02446 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SP4Q02446 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SP4Q02446 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SP4Q02446 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SP4Q02446 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SP4Q02446 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SP4Q02446 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SP4Q02446 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SP4Q02446 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SP4Q02446 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SP4Q02446 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SP4Q02446 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SP4Q02446 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SP4Q02446 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SP4Q02446 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SP4Q02446 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SP4Q02446 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SP4Q02446 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SP4Q02446 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SP4Q02446 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SP4Q02446 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SP4Q02446 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SP4Q02446 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SP4Q02446 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SP4Q02446 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SP4Q02446 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SP4Q02446 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SP4Q02446 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SP4Q02446 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SP4Q02446 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SP4Q02446 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP4Q02446 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP4Q02446 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP4Q02446 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP4Q02446 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP4Q02446 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP4Q02446 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SP4Q02446 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SP4Q02446 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SP4Q02446 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SP4Q02446 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SP4Q02446 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SP4Q02446 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SP4Q02446 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SP4Q02446 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SP4Q02446 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SP4Q02446 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SP4Q02446 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SP4Q02446 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SP4Q02446 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SP4Q02446 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SP4Q02446 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SP4Q02446 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SP4Q02446 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SP4Q02446 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SP4Q02446 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SP4Q02446 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SP4Q02446 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SP4Q02446 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SP4Q02446 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SP4Q02446 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SP4Q02446 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SP4Q02446 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SP4Q02446 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SP4Q02446 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SP4Q02446 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SP4Q02446 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SP4Q02446 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SP4Q02446 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SP4Q02446 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SP4Q02446 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SP4Q02446 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SP4Q02446 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SP4Q02446 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SP4Q02446 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SP4Q02446 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SP4Q02446 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SP4Q02446 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SP4Q02446 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SP4Q02446 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SP4Q02446 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SP4Q02446 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms