Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 DUS3YLR401C 2007 nt7.81□□□□□ -1.16
NUP49Q02199 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.81□□□□□ -1.16
NUP49Q02199 YPR126CYPR126C 309 nt7.81□□□□□ -1.16
NUP49Q02199 GGA2YHR108W 1758 nt7.81□□□□□ -1.16
NUP49Q02199 UFD1YGR048W 1086 nt7.79□□□□□ -1.16
NUP49Q02199 YMR210WYMR210W 1350 nt7.79□□□□□ -1.16
NUP49Q02199 YIL177CYIL177C 5277 nt7.78□□□□□ -1.16
NUP49Q02199 YEL008WYEL008W 381 nt7.78□□□□□ -1.16
NUP49Q02199 SPS100YHR139C 981 nt7.78□□□□□ -1.16
NUP49Q02199 FTH1YBR207W 1398 nt7.77□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 YKL053WYKL053W 375 nt7.77□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 POP2YNR052C 1302 nt7.77□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.76□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.76□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.76□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 ADE16YLR028C 1776 nt7.76□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 SBP1YHL034C 885 nt7.75□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 MCM5YLR274W 2328 nt7.75□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 SAN1YDR143C 1833 nt7.75□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 AMF1YOR378W 1548 nt7.74□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 MRS4YKR052C 915 nt7.74□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 IML3YBR107C 738 nt7.73□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 ESS1YJR017C 513 nt7.72□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 ABZ2YMR289W 1125 nt7.72□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 DIA4YHR011W 1341 nt7.72□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 CTI6YPL181W 1521 nt7.72□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 TPN1YGL186C 1740 nt7.72□□□□□ -1.17
NUP49Q02199 snR86snR86 1004 nt7.71□□□□□ -1.18
NUP49Q02199 LEA1YPL213W 717 nt7.71□□□□□ -1.18
NUP49Q02199 AAC3YBR085W 924 nt7.71□□□□□ -1.18
NUP49Q02199 MHF1YOL086W-A 273 nt7.7□□□□□ -1.18
NUP49Q02199 STE4YOR212W 1272 nt7.69□□□□□ -1.18
NUP49Q02199 ENO2YHR174W 1314 nt7.69□□□□□ -1.18
NUP49Q02199 YLR349WYLR349W 507 nt7.68□□□□□ -1.18
NUP49Q02199 ABP1YCR088W 1779 nt7.66□□□□□ -1.18
NUP49Q02199 TAF13YML098W 504 nt7.66□□□□□ -1.18
NUP49Q02199 PFS2YNL317W 1398 nt7.65□□□□□ -1.18
NUP49Q02199 LPD1YFL018C 1500 nt7.64□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.64□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.64□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.64□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 SRP54YPR088C 1626 nt7.63□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 TMS1YDR105C 1422 nt7.63□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 POT1YIL160C 1254 nt7.63□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 HIS3YOR202W 663 nt7.63□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 MAS1YLR163C 1389 nt7.62□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 TPC1YGR096W 945 nt7.62□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 MDH2YOL126C 1134 nt7.62□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 GAS1YMR307W 1680 nt7.62□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 HSV2YGR223C 1347 nt7.61□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 CPD1YGR247W 720 nt7.61□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 LEU2YCL018W 1095 nt7.61□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 FRA1YLL029W 2250 nt7.6□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 NAM8YHR086W 1572 nt7.59□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 PTC6YCR079W 1329 nt7.59□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 RAD51YER095W 1203 nt7.59□□□□□ -1.19
NUP49Q02199 PAR32YDL173W 888 nt7.58□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 SLM3YDL033C 1254 nt7.57□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 LYS20YDL182W 1287 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 NIF3YGL221C 867 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 YJL009WYJL009W 327 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 REX2YLR059C 810 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 GSF2YML048W 1212 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 PMT7YDR307W 1989 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 YBR056WYBR056W 1506 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 TUB4YLR212C 1422 nt7.55□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 ADH7YCR105W 1086 nt7.55□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 NDE2YDL085W 1638 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 APS2YJR058C 444 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 YPT11YNL304W 1254 nt7.53□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 TOM71YHR117W 1920 nt7.52□□□□□ -1.2
NUP49Q02199 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.52□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 TIF3YPR163C 1311 nt7.52□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 MEP1YGR121C 1479 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 YNL190WYNL190W 615 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 PAU15YIR041W 375 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 MET30YIL046W 1923 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 ALR1YOL130W 2580 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 AIM34YMR003W 597 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 YNL140CYNL140C 570 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 BUD31YCR063W 474 nt7.48□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 GLY1YEL046C 1164 nt7.48□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 YJR149WYJR149W 1215 nt7.48□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 BUB2YMR055C 921 nt7.48□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 MRN1YPL184C 1839 nt7.48□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 YIR035CYIR035C 765 nt7.47□□□□□ -1.21
NUP49Q02199 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 PAU5YFL020C 369 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 NAS2YIL007C 663 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 NSG2YNL156C 900 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 PGC1YPL206C 966 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 CDD1YLR245C 429 nt7.45□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 INO1YJL153C 1602 nt7.45□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 LAS17YOR181W 1902 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 THP3YPR045C 1413 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 ITR1YDR497C 1755 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 MET13YGL125W 1803 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 INM1YHR046C 888 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 FSH2YMR222C 672 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 SPE2YOL052C 1191 nt7.44□□□□□ -1.22
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