Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK16Q00536 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK16Q00536 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK16Q00536 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK16Q00536 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms