Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3F3AP84243 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3F3AP84243 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3AP84243 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms