Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBX1P83916 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBX1P83916 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CBX1P83916 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CBX1P83916 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CBX1P83916 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CBX1P83916 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBX1P83916 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBX1P83916 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CBX1P83916 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CBX1P83916 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBX1P83916 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBX1P83916 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBX1P83916 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBX1P83916 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBX1P83916 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CBX1P83916 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CBX1P83916 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBX1P83916 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBX1P83916 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBX1P83916 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBX1P83916 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBX1P83916 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBX1P83916 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBX1P83916 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBX1P83916 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBX1P83916 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBX1P83916 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBX1P83916 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBX1P83916 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBX1P83916 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBX1P83916 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBX1P83916 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBX1P83916 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBX1P83916 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBX1P83916 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBX1P83916 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBX1P83916 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBX1P83916 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX1P83916 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX1P83916 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX1P83916 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX1P83916 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBX1P83916 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX1P83916 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX1P83916 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX1P83916 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CBX1P83916 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX1P83916 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX1P83916 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX1P83916 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX1P83916 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX1P83916 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX1P83916 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBX1P83916 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX1P83916 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX1P83916 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX1P83916 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX1P83916 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBX1P83916 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX1P83916 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBX1P83916 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CBX1P83916 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CBX1P83916 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CBX1P83916 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CBX1P83916 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBX1P83916 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CBX1P83916 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBX1P83916 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBX1P83916 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX1P83916 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX1P83916 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBX1P83916 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX1P83916 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX1P83916 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX1P83916 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBX1P83916 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBX1P83916 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBX1P83916 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBX1P83916 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CBX1P83916 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CBX1P83916 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CBX1P83916 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CBX1P83916 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CBX1P83916 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CBX1P83916 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBX1P83916 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBX1P83916 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBX1P83916 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBX1P83916 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBX1P83916 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBX1P83916 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBX1P83916 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBX1P83916 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBX1P83916 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBX1P83916 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBX1P83916 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBX1P83916 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBX1P83916 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBX1P83916 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms