Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPS35P82673 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS35P82673 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS35P82673 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPS35P82673 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms