Protein–RNA interactions for Protein: P61619

SEC61A1, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC61A1P61619 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC61A1P61619 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC61A1P61619 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC61A1P61619 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms