Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS3AP61247 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS3AP61247 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS3AP61247 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms