Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPS2P61201 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPS2P61201 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPS2P61201 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPS2P61201 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPS2P61201 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPS2P61201 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPS2P61201 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPS2P61201 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPS2P61201 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPS2P61201 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPS2P61201 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPS2P61201 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPS2P61201 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPS2P61201 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPS2P61201 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPS2P61201 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPS2P61201 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPS2P61201 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPS2P61201 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COPS2P61201 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPS2P61201 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COPS2P61201 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPS2P61201 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPS2P61201 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COPS2P61201 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPS2P61201 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPS2P61201 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPS2P61201 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPS2P61201 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPS2P61201 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPS2P61201 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPS2P61201 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPS2P61201 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPS2P61201 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPS2P61201 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPS2P61201 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COPS2P61201 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COPS2P61201 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COPS2P61201 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COPS2P61201 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COPS2P61201 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPS2P61201 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPS2P61201 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPS2P61201 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPS2P61201 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPS2P61201 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPS2P61201 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPS2P61201 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPS2P61201 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPS2P61201 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPS2P61201 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPS2P61201 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPS2P61201 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPS2P61201 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPS2P61201 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPS2P61201 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPS2P61201 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPS2P61201 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPS2P61201 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPS2P61201 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPS2P61201 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COPS2P61201 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPS2P61201 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPS2P61201 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPS2P61201 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPS2P61201 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPS2P61201 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPS2P61201 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPS2P61201 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPS2P61201 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPS2P61201 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPS2P61201 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPS2P61201 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPS2P61201 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPS2P61201 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COPS2P61201 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPS2P61201 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPS2P61201 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COPS2P61201 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPS2P61201 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPS2P61201 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPS2P61201 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPS2P61201 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPS2P61201 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPS2P61201 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPS2P61201 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPS2P61201 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPS2P61201 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPS2P61201 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPS2P61201 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPS2P61201 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPS2P61201 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPS2P61201 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPS2P61201 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPS2P61201 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPS2P61201 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPS2P61201 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPS2P61201 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPS2P61201 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms