Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB2AP61019 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB2AP61019 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB2AP61019 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms