Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA6P60900 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMA6P60900 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA6P60900 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms