Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
EIF4A1P60842 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
EIF4A1P60842 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
EIF4A1P60842 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
EIF4A1P60842 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
EIF4A1P60842 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
EIF4A1P60842 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
EIF4A1P60842 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
EIF4A1P60842 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EIF4A1P60842 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EIF4A1P60842 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EIF4A1P60842 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms